Die Fakultät vergibt einmal jährlich Fakultätspreise. Die „Beste Habilitation“ sowie die „Beste Publikation“ werden vom Habilitationsausschuss aufgrund der Vorschläge der Klinik- und Institutsleitungen ausgewählt. Die „Beste Promotion“ wird vom Promotionsausschuss aus den Promotionen des jeweiligen Jahres ausgewählt, die mit „summe cum laude“ abgeschlossen haben. Es winkt ein Preisgeld in Höhe von 1.500 Euro pro Kategorie. 

Die Fakultätspreise werden rückwirkend ermittelt. Dabei hat sich das Verfahren wie folgt geändert: Die „Beste Promotion“ wird aus den „summa cum laude“-Promotionen des Jahres 2022 vom Promotionsausschuss ermittelt. Die „Beste Habilitation“ wird aus den Habilitationen des Vorjahres vom Habilitationsausschuss direkt ermittelt. Beide Auszeichnungen erfolgen ohne Bewerbungsverfahren. Die „Beste Publikation 2024“ wird aus den Vorschlägen der Klinik- und Institutsleitungen ermittelt. Hier können Vorschläge an den Dekan geschickt werden, die Auswahl wird dann durch den Habilitationsausschuss getroffen.